autodidact · cancer proteogenomics

CPTAC 암 멀티오믹스 마커 랜드스케이프

Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC) 의 Cell / Cancer Cell 핵심 논문 10편을 종합합니다. 게놈만으로는 보이지 않던 단백·인산화·아세틸화·당단백 마커가 어떻게 9가지 암종에서 임상적 의미를 얻었는지 — 원문 PDF에서 직접 추출한 정량 수치로 비교합니다.

작성자: Jongseo Park  ·  업데이트: 2026-05-10  ·  출처: CPTAC Cell/Cancer Cell 2019–2023
10
분석 논문 수
9
CPTAC 암종
1,347
총 코호트 환자
220K+
정량 인산화 부위
25K+
정량 아세틸화 부위
01

정량 단백체 · 인산화체 규모

CPTAC는 NCI 주도 컨소시엄으로, 2019–2023년에 9가지 주요 암종에 대한 대규모 단백유전체 특성화 연구를 발표했습니다. 각 연구는 WGS/WES + RNA-seq + 단백체 + 인산화체 (± 아세틸화체, 당단백질체, 대사체)를 통합해 게놈만으로는 포착되지 않는 임상적 마커를 도출합니다.

02

단백체 vs 인산화체 산점도

버블 크기는 코호트 환자 수에 비례합니다. 췌장암(PDAC)이 가장 깊은 인산화체 — 51K+ 부위 — 데이터셋을 보유합니다.

03

아세틸화 · 당단백 · 지질 추가 레이어

기본 단백·인산화 레이어 외 추가 PTM 또는 분자 종을 측정한 암종만 표시합니다. PDAC은 N-당단백, GBM은 지질학을 동반합니다.

04

암종별 치료 타겟 마커

원문에서 직접 치료 타겟으로 지목된 단백/인산화 부위 수입니다. 해당 단백 이름은 호버하면 표시됩니다.

05

마커 카테고리 분포

10편 논문 전체에서 도출된 마커를 PTM 유형별로 분류한 분포입니다.

06

암종별 발견 마커 카드

각 카드에는 해당 논문의 코호트, 정량 단백/인산화 규모, 치료 타겟 마커, 핵심 인산화·아세틸화·당단백 부위, 그리고 핵심 발견을 정리합니다.

07

CPTAC 정량 데이터 요약

10편 논문의 정량 마커 수치 비교표입니다.

교차 암종 패턴 — 본 종합에서 반복적으로 등장하는 5가지 신호
  • PTPN11 인산화 수렴 취약점 — 폐선암(Gillette 2020) · 교모세포종(Wang 2021) 모두에서 EGFR/RTK 경로의 공통 하위 허브로 지목.
  • Rb 인산화 = CDK4/6 바이오마커 — 대장암(Vasaikar 2019) · 유방암(Krug 2020) 에서 확립, 폐편평암(Satpathy 2021)에서 확장.
  • 해당작용 → 면역 배제 — MSI-H 대장암(Vasaikar 2019) · 췌장암(Cao 2021) 공통, 일반 원리 후보.
  • 아세틸화체 = 대사·후성유전 동시 판독 — 유방암(Krug 2020) · 자궁내막암(Dou 2020) · 교모세포종(Wang 2021) 에서 아형 특이 패턴.
  • 4종 면역 아형 구조 — 신장암(Clark 2019) · 교모세포종(Wang 2021) 에서 독립적으로 동일 4-class 분류 도출.